Экспозиции по региональной геологии расположены в трех залах (Европейском, Азиатском и частично Центральном) и систематизированы по изначально заложенному геолого-географическому принципу районирования.

По каждому региону представлены основные разновидности горных пород, сгруппированных по общим, региональным и местным стратиграфическим подразделениям или комплексам, и геологическому возрасту, руководящие формы органических остатков, основные виды полезных ископаемых. Каменный материал сопровождается графическими материалами (картами, схемами, колонками, разрезами) и пояснительными текстами.